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准教授　三輪誠（Makoto Miwa ／ ミワ　マコト）

業績

年度 題目 著者 発表日
2022 Integrating heterogeneous knowledge graphs into drug–drug interaction extraction from the literature Masaki Asada、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2022年11月23日
2022 Comparing neural models for nested and overlapping biomedical event detection Kurt Espinosa（*）、 Panagiotis Georgiadis（*）、 Fenia Christopoulou（*）、 Meizhi Ju（*）、 Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（*） 2022年06月02日
2022 Improving Supervised Drug-Protein Relation Extraction with Distantly Supervised Models Naoki Iinuma、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2022年05月26日
2021 日本手話における手型変化 原大介、 三輪誠 2021年12月
2021 TTI-COIN at BioCreative VII Track 1 Naoki Iinuma、 Masaki Asada、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2021年11月09日
2021 TTI-COIN at BioCreative VII Track 2 Tomoki Tsujimura、 Ryuki Ida、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2021年11月09日
2021 A Neural Edge-Editing Approach for Document-Level Relation Graph Extraction Kohei Makino、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2021年08月
2021 Representing a Heterogeneous Pharmaceutical Knowledge-Graph with Textual Information Masaki Asada、 NALLAPPAN, Gunasekaran、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2021年07月01日
2020 再帰ニューラルネットを用いた車両運動性の代理モデリング 牧野晃平（知能数理）、 新谷浩平、 阿部充治、 三輪誠、 佐々木裕 2020年11月25日
2020 mgsohrab at WNUT 2020 Shared Task-1: Neural Exhaustive Approach for Entity and Relation Recognition Over Wet Lab Protocols Mohammad Golam Sohrab（*）、 Anh-Khoa Duong Nguyen（*）、 Makoto Miwa、 Hiroya Takamura（*） 2020年11月19日
2020 Syntactically-Informed Word Representations from Graph Neural Network Thy Thy Tran（*）、 Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（*） 2020年11月
2020 Using Drug Descriptions and Molecular Structures for Drug-Drug Interaction Extraction from Literature 浅田真生（知能数理）、 三輪誠、 佐々木裕 2020年10月24日
2020 BENNERD: A Neural Named Entity Linking System for COVID-19 Mohammad Golam Sohrab（*）、 Khoa Duong（*）、 Makoto Miwa、 Goran Topic（*）、 Ikeda Masami（*）、 Hiroya Takamura（*） 2020年10月
2020 DeepEventMine: : End-to-end Neural Nested Event Extraction from Biomedical Texts Hai-Long Trieu（*）、 Thy Thy Tran（*）、 Khoa N. A. Duong（*）、 Anh Nguyen（*）、 Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（*） 2020年10月
2020 関係分類における依存木上の重要トークンの自動判別 辻村有輝（知能数理）、 三輪誠、 佐々木裕 2020年06月
2019 コーディングと動画を併用した日本手話音節の適格性予測 高藤朋史、 三輪誠、 原大介 2020年03月
2019 Ontology-Style Relation Annotation: A Case Study Savong Bou、 Naoki Suzuki（知能数理）、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2020年03月
2019 Adverse Drug Events and Medication Relation Extraction in EHRs with Ensemble Deep Learning Methods Fenia Christopoulou（*）、 Thy Thy Tran（*）、 Sunil Kumar Sahu（*）、 Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（*） 2020年01月01日
2019 An Ensemble of Neural Models for Nested Adverse Drug Events and Medication Extraction with Subwords Meizhi Ju（*）、 Nhung T.H. Nguyen（*）、 Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（*） 2020年01月
2019 Connecting the Dots: Document-level Neural Relation Extraction with Edge-oriented Graphs Fenia Christopoulou（*）、 Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（*） 2019年11月04日
2019 A Search-based Neural Model for Biomedical Nested and Overlapping Event Detection Kurt Espinosa（*）、 Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（*） 2019年11月04日
2019 Coreference Resolution in Full Text Articles with BERT and Syntax-based Mention Filtering Hai-Long Trieu（*）、 Anh-Khoa Duong Nguyen（*）、 Nhung Nguyen（*）、 Makoto Miwa、 Hiroya Takamura（*）、 Sophia Ananiadou（*） 2019年11月04日
2019 A Neural Pipeline Approach for the PharmaCoNER Shared Task using Contextual Exhaustive Models Mohammad Golam Sohrab（*）、 Pham Minh Thang （*）、 Makoto Miwa、 Hiroya Takamura（*） 2019年11月04日
2019 A Generic Neural Exhaustive Approach for Entity Recognition and Sensitive Span Detection Mohammad Golam Sohrab（*）、 Pham Minh Thang（*）、 Makoto Miwa 2019年09月24日
2019 Inter-sentence Relation Extraction with Document-level Graph Convolutional Neural Network Sunil Kumar Sahu（*）、 Fenia Christopoulou（*）、 Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（*） 2019年07月28日
2018 深層学習を用いた日本手話音節の適格性解析 高藤朋史（知能数理）、 三輪　誠、 佐々木裕、 原大介 2019年03月
2018 Deep Exhaustive Model for Nested Named Entity Recognition Mohammad Golam Sohrab（*）、 Makoto Miwa 2018年11月02日
2018 Investigating Domain-Specific Information for Neural Coreference Resolution on Biomedical Texts Long Trieu（*）、 Nhung Nguyen（*）、 Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（*） 2018年07月19日
2018 Enhancing Drug-Drug Interaction Extraction from Texts by Molecular Structure Information Masaki Asada、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2018年07月16日
2018 A Walk-based Model on Entity Graphs for Relation Extraction Fenia Christopoulou（*）、 Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（*） 2018年07月16日
2018 A neural layered model for nested named entity recognition Meizhi Ju（*）、 Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（*） 2018年06月03日
2017 EDGE2VEC: Edge Representations for Large-Scale Scalable Hierarchical Learning Mohammad Golam Sohrab（*）、 Toru Nakata（*）、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2017年12月01日
2017 Utilizing visual forms of Japanese characters for neural review classification Yota Toyama 、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2017年11月27日
2017 Analyzing well-formedness of syllables in Japanese Sign Language Satoshi Yawata、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki、 Hara Daisuke 2017年11月27日
2017 Extracting Drug-Drug Interactions with Attention CNNs Masaki Asada 、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2017年08月04日
2017 TTI-COIN at SemEval-2017 Task 10: Investigating Embeddings for End-to-End Relation Extraction from Scientific Papers Tomoki Tsujimura 、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2017年08月03日
2017 Bib2vec: Embedding-based Search System for Bibliographic Information Takuma Yoneda、 Koki Mori 、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2017年04月03日
2016 Distributional Hypernym Generation by Jointly Learning Clusters and Projections Josuke Yamane、 Tomoya Takatani（*）、 Hitoshi Yamada（*）、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2016年12月15日
2016 IN-DEDUCTIVE and DAG-Tree Approaches for Large-Scale Extreme Multi-label Hierarchical Text Classification Mohammad Golam Sohrab、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2016年10月30日
2016 End-to-End Relation Extraction using LSTMs on Sequences and Tree Structures Makoto Miwa、 Mohit Bansal（TTIC） 2016年08月08日
2016 Topic Detection Using Paragraph Vectors to Support Active Learning in Systematic Reviews Kazuma Hashimoto（*）、 Georgios Kontonatsios（*）、 Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（*） 2016年08月01日
2016 Ensemble Classification of Grants using LDA-based features Ioannis Korkontzelos（*）、 Beverley Thomas（*）、 Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（*） 2016年05月25日
2015 Stacking Approach to Temporal Relation Classification with Temporal Inference Natsuda Laokulrat（The University of Tokyo）、 Makoto Miwa、 Yoshimasa Tsuruoka（The University of Tokyo） 2015年09月
2015 Identifying synonymy between relational phrases using word embeddings Nhung T. H. Nguyen（JAIST）、 Makoto Miwa、 Yoshimasa Tsuruoka（The University of Tokyo）、 Satoshi Tojo（JAIST） 2015年08月
2015 Task-Oriented Learning of Word Embeddings for Semantic Relation Classification Kazuma Hashimoto（The University of Tokyo）、 Pontus Stenetorp（University College London）、 Makoto Miwa、 Yoshimasa Tsuruoka（The University of Tokyo） 2015年07月30日
2015 Adaptable, High Recall, Event Extraction System with Minimal Configuration Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（University of Manchester） 2015年06月23日
2015 Word Embedding-based Antonym Detection using Thesauri and Distributional Information Masataka Ono（知能数理）、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2015年05月31日
2015 Centroid-Means-embedding: An Approach to Infusing Word Embeddings into Features for Text Classifcation Mohammad Golam Sohrab、 Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2015年04月17日
2015 Wide-Coverage Relation Extraction from MEDLINE Using Deep Syntax Nhung T. H. Nguyen（JAIST）、 Makoto Miwa、 Yoshimasa Tsuruoka（The University of Tokyo）、 Takashi Chikayama（The University of Tokyo）、 Satoshi Tojo（JAIST） 2015年04月01日
2014 Using text mining for study identification in systematic reviews: a systematic review of current approaches Alison O'Mara-Eves（Univ. of London）、 James Thomas（Univ. of London）、 John McNaught（Univ. of Manchester）、 Makoto Miwa、 Sophia Ananiadou（Univ. of Manchester） 2015年01月14日
2014 対数線形言語モデルを用いた将棋解説文の自動生成 亀甲 博貴 (東大) 、 三輪　誠、 鶴岡 慶雅 (東大) 、 森 信介 (京大) 、 近山 隆 (東大) 2014年11月15日
2014 多人数性を分割した教師付き学習による4人麻雀プログラムの実現 水上 直紀 (東大)、 中張 遼太郎 (東大)、 浦 晃 (東大)、 三輪　誠、 鶴岡 慶雅 (東大)、 近山 隆 (東大) 2014年11月15日
2014 Modeling Joint Entity and Relation Extraction with Table Representation Makoto Miwa、 Yutaka Sasaki 2014年10月25日
2014 Reducing systematic review workload through certainty-based screening Makoto Miwa、 James Thomas（Univ. of London）、 Alison O'Mara-Eves（Univ. of London）、 Sophia Ananiadou（Univ. of Manchester） 2014年10月
2014 Comparable Study of Event Extraction in Newswire and Biomedical Domains Makoto Miwa、 Paul Thompson (Univ. of Manchester)、 （Ioannis Korkontzelos (Univ. of Manchester)）、 Sophia Ananiadou (Univ. of Manchester) 2014年08月29日

プロフィール

学位 博士（科学）  
生年月日 年齢
所属研究室 知能数理研究室
研究分野 Natural language processing; Deep learning; Artificial Intelligence in Games
URL http://www.toyota-ti.ac.jp/Lab/Denshi/COIN/people/makoto.miwa/
最終学歴 東京大学大学院新領域創成科学研究科博士課程修了 (2008年3月)
職歴 産業技術総合研究所 人工知能研究センター 招聘研究員　（2015年04月01日～現在）
豊田工業大学 准教授　（2014年04月01日～現在）
マンチェスター大学 Research Associate　（2011年04月01日～2014年03月31日）
東京大学大学院 特任研究員　（2008年04月01日～2011年03月31日）
主な研究論文 ・Makoto Miwa and Mohit Bansal, “End-to-End Relation Extraction using LSTMs on Sequences and Tree Structures”，Proceedings of the 54th Annual Meeting of the Association for Computational Linguistics Vol. １, pp. 1105-1116（2016.08.08）
・Makoto Miwa and Yutaka Sasaki, “Modeling Joint Entity and Relation Extraction with Table Representation”，Proceedings of the 2014 Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing, pp. 1858-1869 （2014.10.25）
・Makoto Miwa, Tomoko Ohta, Rafal Rak, Andrew Rowley, Douglas B. Kell, “Sampo Pyysalo and Sophia Ananiadou, A method for integrating and ranking the evidence for biochemical pathways by mining reactions from text”，Bioinformatics Vol. 29, No. 13, pp. i44-i52（2013.07.01）
・Makoto Miwa, Paul Thompson and Sophia Ananiadou, “Boosting automatic event extraction from the literature using domain adaptation and coreference resolution”，Bioinformatics Vol. 28, No. 13, pp. 1759-1765（2012.07.01）
・Makoto Miwa, Rune Sætre, Yusuke Miyao, and Jun'ichi Tsujii, “A Rich Feature Vector for Protein-Protein Interaction Extraction from Multiple Corpora”，Proceedings of the 2009 Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing, pp. 121-130（2009.08.06）
学会活動 ・ACM Transactions on Asian and Low-Resource Language Information Processing (TALLIP)(査読員） 2016, 2021
・ACM Transactions on Intelligent Systems and Technology （査読員）2020
・Applied Computing and Informatics（査読員）2018
・Artificial Intelligence（査読員）2019
・Bioinformatics（査読員）2014, 2015, 2016, 2020, 2021
・BMC Bioinformatics（査読員）2014，2017, 2019
・BMC Medical Informatics and Decision Making（査読員）2020
・BMC supplements (査読員) 2020
・BioNLP-ST'13 Journal (査読員)
・Computers in Biology and Medicine (査読員) 2014
・Computational Linguistics (standing reviewer) 2020-
・DATABASE（査読員）2015, 2017, 2018, 2022
・Engineering Applications of Artificial Intelligence (EAAI)（査読員）2015
・Expert Systems With Applications（査読員）2017, 2020, 2021
・frontiers in Research Metrics and Analytics (Editorial Board) 2020-
・Genomics and Computational Biology（査読員）2015
・IEEE/ACM Transactions on Audio, Speech and Language Processing（査読員）2019, 2020
・IEEE Transactions on Big Data (査読員), 2020
・IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems（査読員）2017, 2022
・IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence (査読員) 2020
・Information Sciences（査読員）2019, 2021
・Journal of Biomedical Informatics (査読員) 2014, 2015, 2016, 2017
・Knowledge and Information Systems (KAIS), 2021
・Knowledge-Based Systems, 2022
・Neurocomputing（査読員）2014, 2019
・PLOS ONE（査読員）2015, 2017
・Transactions of the Association for Computational Linguistics（査読員) 2019 (standing reviewer) 2020-
・自然言語処理（査読員）2016, （編集委員）2016-2020
・情報処理学会論文誌 (査読員) 2014, 2016，（編集委員）2017-2021
・情報処理学会論文誌データベース (査読員) 2020
・人工知能学会誌（査読員）2014, 2016
・日本ソフトウェア科学会コンピュータソフトウェア誌（査読員）2014
・電子情報通信学会学会誌（査読員）2017, 2018, 2019 (編集委員) 2020-
・AAAI 2020（プログラム委員）, 2021
・AACL-IJCNLP 2021 (プログラム委員)
・ACG 2019（プログラム委員）
・ACIT 2015（プログラム委員）
・ACL 2017-2019（プログラム委員）, 2021 (Area Chair)
・ACL Rolling Review, 2021 May, Sep, Oct (査読員），　2021 Nov, 2022 Jan, Feb （Area chair)
・ACL System Demonstrations, 2018, 2019（プログラム委員)
・BioNLP 2014-2018 (プログラム委員）
・BioTxtM 2016 (プログラム委員）
・BLAH 2015（プログラム委員）
・CIG 2015（プログラム委員）
・CG 2018（プログラム委員）
・Coling 2014, 2018, 2020（プログラム委員）2020 (Area Chair)
・DTMBIO 2014-2018 (プログラム委員）
・ECAI 2014 (プログラム委員）
・EMNLP 2015, 2016, 2019（プログラム委員）2018, 2020, 2021 (Area Chair)
・EUSPN 2016-2020（プログラム委員）
・ICML 2021 (プログラム委員)
・IJCAI 2016, 2019, 2020, 2022 (プログラム委員）2021 (シニアプログラム委員）
・IJCNLP 2017 (プログラム委員）
・NAACL 2016, 2018, 2019, 2021（プログラム委員）
・RANLP 2015, 2017（プログラム委員）
・SMBM 2014（プログラム委員）
・SNL 2017-2019（プログラム委員）
・*SEM 2016（プログラム委員）
・W-NUT 2020（プログラム委員）
・ゲームプログラミングワークショップ 2014-2021（プログラム委員）
・言語処理学会年次大会 2016-2022（大会賞審査委員）, 2020 (運営委員)
・第10, 11回NLP若手の会（運営委員）
・情報処理学会 ゲーム情報学研究運営委員会（運営委員）2015
・情報処理学会 自然言語処理研究会 （運営委員) 2019-
・Association for Computational Linguistics（会員）
・人工知能学会（会員）
・情報処理学会（会員）
・言語処理学会（会員）
・電子情報通信学会（会員）
社会活動（研究に関する学会活動以外）  
学内運営（委員会活動等） TTIC委員会・委員 (2014年度-)
総合安全委員会・委員 (2015年度-2016年度)
学外実習委員会・拡大委員 (2014年度-2018年度, 2020年度-)
総合情報センター協議会・拡大委員 (2016年度)
難環境作業スマート機械技術研究センター協議会・委員(2014年度-2017年度)
学生委員会・委員 (2017年度-2018年度)
教務委員会・委員 (2019年度-)
入学者選抜制度委員会・委員 (2019年度-)
情報ワーキンググループ・委員 (2018年度-)
教養ワーキンググループ・委員 (2018年度-) 
担当授業科目 学部：コンピュータプログラミング基礎および実習 1・2 (2014)，ソフトウェア実験 (2014-), プログラミング技法 (2015-), コンピュータアーキテクチャ (2015-), 工学基礎実験2 (2016-2017), 離散数学 (2018-) 
修士：機械学習入門1 (2015-)，離散数学2 (2016) 
教育実践上の主な業績 １　教育内容・方法の工夫（授業評価等を含む）

１ 演習の効果的活用（2019年度～）
「離散数学」（３年次前期，２単位），「コンピュータアーキテクチャ」(３年次後期，２単位) ，「機械学習入門１」（修士後期，２単位，分担）において，受講生に演習問題を授業中に実際に解いてもらうことで，理解の促進に努めた．

２ プログラム評価システムの活用（2019年度～）
「プログラミング技法」(２年次前期，２単位) において，プログラムを投稿できるWebシステムを準備し，練習問題を準備することで，受講生がプログラミング問題に対応するプログラムを投稿して自動評価されるようにすることで，受講生がその場で正解・不正解の確認ができるようにするとともに，受講生のプログラムの間違いのパターンを把握し，フィードバックした．

３ 試験問題回答例のWebでの公開（2019年度～）
「プログラミング技法」(２年次前期，２単位)の定期試験，「離散数学」（３年次前期，２単位）の定期試験，「コンピュータアーキテクチャ」(３年次後期，２単位) の中間試験・定期試験，「機械学習入門1」(修士後期，２単位，分担)の定期試験の定期試験を問題・回答ともに公開し，復習ができるようにした．

２　作成した教科書、教材、参考書

１ 「プログラミング技法」（２年次前期，２単位）用の教材（2019年度～）
授業用資料 (15回分), 演習問題 (14回分) を作成し，学生に配布した．

２ 「コンピュータ・アーキテクチャ」（３年次後期，２単位）用の教材（2019年度～）
授業用資料 (15回分)，演習問題 (6回分) を作成し，学生に配布した．

３「ソフトウェア実験」（３年次前期，１単位）用の教材（2019年度～）
実験用の教材を作成・更新し，学生に配布した．

４「機械学習入門１」（修士後期，２単位，分担）（2019年度～）
授業用資料 (8回分) ，演習問題（5回分）, 英語テスト（8回分）を作成し，
学生に配布した．

５「離散数学」（３年次前期，２単位）用の教材（2019年度～）
授業用資料 (15回分)，演習課題 (6回分) を作成し，学生に配布した．

６「情報リテラシー」（1年次前期，２単位）（2019年度〜）
授業用資料 (1回分)を作成し，学生に配布した．

７「論理学」（1年次前期，3年次前期 (2019年度)，２単位）（2019年度〜）
授業用資料 (1回分)を作成し，学生に配布した．

３　教育方法・教育実践に関する発表、講演等

なし

４　その他教育活動上特記すべき事項

なし 
その他

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